Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps1O08983 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms