Protein–RNA interactions for Protein: O08583

Alyref, THO complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlyrefO08583 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AlyrefO08583 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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