Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20878L7N244 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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