Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm5294J3QP53 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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