Protein–RNA interactions for Protein: J3QNV7

Gm10428, Predicted gene 10428, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10428J3QNV7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm10428J3QNV7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms