Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms