Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20834J3QM72 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms