Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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