Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20828J3KMI7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms