Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r58G3X9U3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms