Protein–RNA interactions for Protein: G3UX18

Gm20726, Predicted gene, 20726, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20726G3UX18 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20726G3UX18 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms