Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms