Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms