Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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