Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms