Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Igkv1-99F6XWB2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms