Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17555F6U8B9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17555F6U8B9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17555F6U8B9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17555F6U8B9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17555F6U8B9 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17555F6U8B9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17555F6U8B9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17555F6U8B9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17555F6U8B9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17555F6U8B9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17555F6U8B9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17555F6U8B9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17555F6U8B9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17555F6U8B9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17555F6U8B9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17555F6U8B9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17555F6U8B9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17555F6U8B9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17555F6U8B9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17555F6U8B9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17555F6U8B9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17555F6U8B9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17555F6U8B9 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17555F6U8B9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17555F6U8B9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17555F6U8B9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17555F6U8B9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17555F6U8B9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm17555F6U8B9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm17555F6U8B9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm17555F6U8B9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm17555F6U8B9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17555F6U8B9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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