Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms