Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16f1E9Q9P8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16f1E9Q9P8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16f1E9Q9P8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16f1E9Q9P8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16f1E9Q9P8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rdh16f1E9Q9P8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16f1E9Q9P8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh16f1E9Q9P8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rdh16f1E9Q9P8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rdh16f1E9Q9P8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rdh16f1E9Q9P8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh16f1E9Q9P8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rdh16f1E9Q9P8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh16f1E9Q9P8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rdh16f1E9Q9P8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rdh16f1E9Q9P8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rdh16f1E9Q9P8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rdh16f1E9Q9P8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh16f1E9Q9P8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh16f1E9Q9P8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh16f1E9Q9P8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh16f1E9Q9P8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh16f1E9Q9P8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rdh16f1E9Q9P8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rdh16f1E9Q9P8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rdh16f1E9Q9P8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Rdh16f1E9Q9P8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Rdh16f1E9Q9P8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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