Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Urb2E9Q7L1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms