Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm20518E9Q548 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm20518E9Q548 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm20518E9Q548 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm20518E9Q548 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm20518E9Q548 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm20518E9Q548 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm20518E9Q548 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Gm20518E9Q548 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Gm20518E9Q548 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Gm20518E9Q548 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Gm20518E9Q548 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20518E9Q548 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm20518E9Q548 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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