Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrp3E9Q1T6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms