Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Zfp558E9Q1J0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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