Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt78E9Q0F0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms