Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc8E9PWG2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms