Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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