Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms