Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6685D3YYP3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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