Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms