Protein–RNA interactions for Protein: C0HKD9

Mfap1b, Microfibrillar-associated protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfap1bC0HKD9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfap1bC0HKD9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfap1bC0HKD9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfap1bC0HKD9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfap1bC0HKD9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfap1bC0HKD9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfap1bC0HKD9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfap1bC0HKD9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfap1bC0HKD9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfap1bC0HKD9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfap1bC0HKD9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfap1bC0HKD9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfap1bC0HKD9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfap1bC0HKD9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfap1bC0HKD9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mfap1bC0HKD9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mfap1bC0HKD9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms