Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms