Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5483B2RV77 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms