Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zscan5bB2RTN3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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