Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms