Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbed5B2RPU8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbed5B2RPU8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbed5B2RPU8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbed5B2RPU8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbed5B2RPU8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbed5B2RPU8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbed5B2RPU8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbed5B2RPU8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbed5B2RPU8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbed5B2RPU8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbed5B2RPU8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbed5B2RPU8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbed5B2RPU8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms