Protein–RNA interactions for Protein: B1AVU6

Gm436, Predicted gene 436, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm436B1AVU6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm436B1AVU6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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