Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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H2-M5A7VMS3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M5A7VMS3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms