Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5640A3KG49 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms