Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Patl2A2ARM1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Patl2A2ARM1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Patl2A2ARM1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Patl2A2ARM1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Patl2A2ARM1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms