Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Rtf1A2AQ19 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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