Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms