Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Lcn6A2AJB9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms