Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms