Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms