Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
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