Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Mrpl40Q9Z2Q5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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