Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Cldn6Q9Z262 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn6Q9Z262 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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