Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccne2Q9Z238 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccne2Q9Z238 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms