Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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