Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU0

Phf2, Lysine-specific demethylase PHF2, mousemouse

Predictions only

Length 1,096 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf2Q9WTU0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf2Q9WTU0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf2Q9WTU0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms